Анна Щербакова родилась в Ленинграде, здесь же и училась. Журналистикой она начала заниматься сразу после того, как получила в ЛГУ высшее образование. Первым местом ее работы стал петербургский филиал ИТАР–ТАСС, куда Анна пришла в 1990 году. Здесь она была корреспондентом.
Проработав 2 года в информагентстве, в 1992 году она перешла в филиал ИД "Коммерсант", однако задержалась в этом издании ненадолго. Уже спустя год — в 1993 году — она заняла пост редактора отдела газеты "Деловой Петербург", проработав на этой должности до 1998 года. После этого на протяжении 2 лет Анна была корреспондентом газеты St. Petersburg Times, а также редактором издания "Карьера — капитал".
В 2000 году Анна Щербакова возглавила петербургское бюро газеты "Ведомости", на это позиции она работает по сей день.
Помимо прочего Анна Щербакова является старшим преподавателем в Высшей школе журналистики и массовых коммуникаций. В 2010 году была удостоена премии Bonnier Journalistic Award.
