Вы хоть краткий анонс новости прочитали? Или ограничились заголовком? На балтийский вокзал экспресс приходить будет. Тоже далеко не идеальный вариант, но из реальных альтернатив остается только Ладожский. :)
Что до короткой ветки метро... Ближайшие — это Проспект Ветеранов и Московская\Звездная. Ветеранов отпадает сразу, по нескольким причинам. 1. она и так трещит по швам в будни. 2. из-за мелкого заложения придется на 2-3 года перекрывать проспект Новаторов (Ветеранов скорее всего тоже) и перекладывать уйму подземных коммуникаций. 4. придется строить 2-3 промежуточные станции в чистом поле, которые никогда никем не будут востребованы. Разве что садоводами.
С Московской ситуация вроде получше, даже есть тупики, к которым теоретически можно пристыковать тоннели... Но и здесь не без проблем: все те же незагруженные промежуточные станции (единый перегон длиной 5-6 км никто строить не разрешит), проблема организации пересадки либо вилочного движения... Ну и самое грустное — стоимость строительства составит приблизительно 25-30 миллиардов. Исходя из существующих реалий финансирования это означает полное прекращение любого другого метростроительства как минимум на 10 лет. Вам нравится такая идея?
Скоростной трамвай — идея в общем неплохая, но тоже довольно затратная и не совсем понятно, куда впихнуть его трассу. Если как предлагалось ранее, на Московский — то намного дешевле наладить нормальное автобусное сообщение.
Так что вариант с аэроэкспрессом, как ни странно, наименее затратный — построить виадук, несколько километров электрифицированной однопутки ну и подкорректировать график на участке Балтийский - Аэропорт. Причем большую часть затрат РЖД берет на себя.

Полная бессмыслица. Центр города и Московский вокзал итак перегружены, особенно после запуска Сапсана. Пробки, толкучка, отсутствие парковок, монстрообразный торговый центр... Почему нельзя было сделать короткую ветку от ближайшего метро - непонятно (метро или скоростной трамвай или монорельс). Как обычно - победил наиболее затратный проект.

По-моему, до метро Купчино быстрее и дешевле.