Баклицкий был задержан в декабре 2008 года в своем рабочем кабинете по подозрению в получении взятки в размере почти полмиллиона рублей. Ему инкриминировались пять эпизодов получения взяток на общую сумму более 1 млн рублей.

Баклицкий признан виновным в совершении преступлений, предусмотренных п. "г" ч. 4 ст. 290, п. "г" ч. 4 ст. 290, ч. 3 ст. 290, п. "г" ч. 4 ст. 290 УК (получение взятки).

По совокупности совершенных преступлений ему назначено наказание в виде 8 лет лишения свободы с отбыванием наказания в исправительной колонии строгого режима.

Также Баклицкого лишили права занимать должности, связанные с организационно–распорядительными, административно–хозяйственными функциями представителя власти в госорганах, органах местного самоуправления, государственных и муниципальных учреждениях и государственных корпорациях сроком на 3 года.

Кроме этого, Леонид Баклицкий должен заплатить 1 млн рублей штрафа в доход государства.